在電場(chǎng)中液體對(duì)于一個(gè)固體的固定相相對(duì)移動(dòng)稱為電滲.在有載體的電泳中，影響電泳移動(dòng)的一個(gè)重要因素是電滲。常遇到的情況是γ-球蛋白，由原點(diǎn)向負(fù)極移動(dòng)，這就是電滲作用所引起的倒移現(xiàn)象.產(chǎn)生電滲現(xiàn)象的原因是載體中常含有可電離的基團(tuán)，如濾紙中含有羥基而帶負(fù)電荷，與濾紙相接觸的水溶液帶正電荷，液體便向負(fù)極移動(dòng)。由于電滲現(xiàn)象往往與電泳同時(shí)存在，所以帶電粒子的移動(dòng)距離也受電滲影響；如電泳方向與電滲相反，則實(shí)際電泳的距離等于電泳距離加上電滲的距離.瓊脂中含有瓊脂果膠，，其中含有較多的硫酸根，所以在瓊脂電泳時(shí)電滲現(xiàn)象很明顯，許多球蛋白均向負(fù)極移動(dòng)。除去了瓊脂果膠后的瓊脂糖用作凝膠電泳時(shí)，電滲大為減弱.電滲所造成的移動(dòng)距離可用不帶電的有色染料或有色葡聚糖點(diǎn)在支持物的中心，以觀察電滲的方向和距離。

電泳介質(zhì)的pH值 溶液的pH值決定帶電物質(zhì)的解離程度，也決定物質(zhì)所帶凈電荷的多少.對(duì)蛋白質(zhì)，氨基酸等類似兩性電解質(zhì)，pH值離等電點(diǎn)越遠(yuǎn)，粒子所帶電荷越多，泳動(dòng)速度越快，反之越慢。因此，當(dāng)分離某一種混合物時(shí)，應(yīng)選擇一種能擴(kuò)大各種蛋白質(zhì)所帶電荷量差別的pH值，以利于各種蛋白質(zhì)的有效分離.為了保證電泳過(guò)程中溶液的pH值恒定，必須采用緩沖溶液。

等電聚焦電泳 是將兩性電解質(zhì)加入盛有pH梯度緩沖液的電泳槽中，當(dāng)其處在低于其本身等電點(diǎn)的環(huán)境中則帶正電荷，向負(fù)極移動(dòng)；若其處在高于其本身等電點(diǎn)的環(huán)境中，則帶負(fù)電向正極移動(dòng)。當(dāng)泳動(dòng)到其自身特有的等電點(diǎn)時(shí)，其凈電荷為零，泳動(dòng)速度下降到零，具有不同等電點(diǎn)的物質(zhì)后聚焦在各自等電點(diǎn)位置，形成一個(gè)個(gè)清晰的區(qū)帶，分辨率。

在確定的條件下，帶電粒子在單位電場(chǎng)強(qiáng)度作用下，單位時(shí)間內(nèi)移動(dòng)的距離（即遷移率）為常數(shù)，是該帶電粒子的物化特征性常數(shù)。不同帶電粒子因所帶電荷不同，或雖所帶電荷相同但荷質(zhì)比不同，在同一電場(chǎng)中電泳，經(jīng)一定時(shí)間后，由于移動(dòng)距離不同而相互分離。分開的距離與外加電場(chǎng)的電壓與電泳時(shí)間成正比。